Eso es porque no ha subido sus archivos a la carpeta principal "public_html" que es donde debe publicar los archivos de su sitio web para que sean vistos al ingresar la URL de su sitio.
También podría pasar que se esté ejecutando el archivo inicial del servidor (index.html) y no el de su sitio (index.htm o index.php). En este caso deberá acceder por FTP y eliminar el mencionado archivo index.html o sobreescribirlo con el archivo index de su sitio.